Séance de cours

Guérison des plaies

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Dans cours

BIO-695: Image Processing for Life Science

Registration details will be announced via email. It takes place yearly from Sept./October to December & intends to teach image processing with a strong emphasis of applications in life sciences. The idea is to enable the participants to solve image-proces ...

Description

Cette séance de cours couvre les essais de cicatrisation des plaies qui mesurent la motilité cellulaire et la capacité de migration après avoir créé un espace dans une culture cellulaire. Les données comprennent des images timelapse de cellules migrant dans différentes conditions: siRNA brouillé vs siRNA cible.

Enseignant·e·s (4)

Romain Guiet

Expertise Development of BioImage Analysis workflows and algorithms to extract quantitative data from microscopy images.BioSample Preparation : in vitro cell, organoid, time-lapse, fixation, staining strategies, actin, mitochondria, fluorescent protein expressionBioImage Acquisition : Widefield, Confocal, Whole Slide Imaging, Super-resolution (SIM, STORM, STED), FRET, FRAP, FLIMBioImage Analysis: Colocalisation analysis, Deconvolution, Time-lapse , Whole Slide ImagingTools & Software: ImageJ/Fiji, QuPath, i

Nicolas René Chiaruttini

Olivier Burri

Expertise Development of bioimage analysis workflows and algorithms to extract quantitative data from microscopy imagesTools & Software: ImageJ/Fiji, CellProfiler, ilastik, Imaris, Arivis, Matlab, RStudio, IntelliJ, Eclipse, Jupyter NotebooksProgramming languages:Java, Groovy, JavaScript, TypeScript, PHP, Python, R, C, C , Matlab, Bash Expertise Development of bioimage analysis workflows and algorithms to extract quantitative data from microscopy imagesTools & Software: ImageJ/Fiji, CellProfiler, ilastik, I

Arne Seitz

Enseignement et PhD Cours Advanced Microscopy for Life Science BIO-659 For further information, please get in contact with the instructor or have a look on the following web-site: http://biop.epfl.ch/ Bioimage informatics BIO-410 Le cours fournit une complète revue des méthodes, algorithmes et des outils logiciels utilisés en analyse d'images biologiques. Il expose les concepts fondamentaux et les solutions informatiques permettant d'extraire des informations quantitatives à

Source officielle

Concepts associés (11)

Cicatrisation

La cicatrisation se présente sous deux aspects : un phénomène de régénération : on parle alors du processus par lequel se réparent les lésions des tissus et des organes (plaie, brûlures) ; un phénomène de consolidation ou de réconciliation d'éléments auparavant unis et qui avaient été séparés. On distingue la cicatrisation "de première intention", qui se produit spontanément et rapidement quand les bords de la plaie sont rapprochés ; et la cicatrisation "de seconde intention", dans le cas contraire, qui nécessite un traitement dermatologique (pommade, solution.

Culture cellulaire

La culture cellulaire est un ensemble de techniques de biologie utilisées pour faire croître des cellules hors de leur organisme (ex-vivo) ou de leur milieu d'origine, dans un but d'expérimentation scientifique ou de fécondation in vitro. Les cellules mises en culture peuvent être: des micro-organismes libres (bactéries ou levures) des cellules « saines » prélevées fraîchement d'un organisme (biopsie...), on parle alors de « culture primaire ».

Guérison

La guérison est l'action de guérir d'une maladie ou le retour à la santé. Au niveau biologique c'est un processus par lequel les cellules du corps se régénèrent pour réduire l'espace d'une région endommagée par la nécrose. La guérison implique la suppression du tissu endommagé et le remplacement de ce tissu. Le remplacement peut se produire de deux façons : Par régénération : les cellules nécrotiques sont remplacées par le même tissu qu'auparavant ; Par réparation : le tissu originel est remplacé par un tissu cicatrisé.

Chronic wound

A chronic wound is a wound that does not heal in an orderly set of stages and in a predictable amount of time the way most wounds do; wounds that do not heal within three months are often considered chronic. Chronic wounds seem to be detained in one or more of the phases of wound healing. For example, chronic wounds often remain in the inflammatory stage for too long. To overcome that stage and jump-start the healing process, a number of factors need to be addressed such as bacterial burden, necrotic tissue, and moisture balance of the whole wound.

Culture tissulaire

vignette|Flacons contenant un milieu de culture de culture tissulaire qui fournit la nourriture nécessaire à la croissance des cellules. La culture tissulaire est la croissance de tissus ou de cellules dans un milieu artificiel séparé de l'organisme parent. Cette technique est également appelée micropropagation. Elle est généralement facilitée par l'utilisation d'un milieu de culture liquide, semi-solide ou solide, tel que le bouillon ou la gélose.

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Séances de cours associées (8)

Microenvironnement tumoral : De Palma

Explore le microenvironnement tumoral, les composantes stromales, les interactions cellulaires et l'impact de l'inflammation sur la promotion du cancer.

Médecine du plasma: Présentation des applications MOOC: Physique des plasmas : Applications

Explore les applications de la médecine plasmatique dans la cicatrisation des plaies, la dentisterie et la cancérologie.

Réponse inflammatoire: 2D MOOC: Introduction à l'immunologie (part 1)

Explore l'initiation et la régulation de la réponse inflammatoire et ses effets systémiques.

Plasma Medicine: Vue d'ensemble MOOC: Physique des plasmas : Applications

Explore le potentiel thérapeutique des plasmas atmosphériques froids dans diverses applications médicales.

Co-localisation

Discute de la quantification de la localisation de la protéine X par rapport à Golgi et Mitochondria dans des images confocales 2D.

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