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Conception des protéines : chemins allostériques dynamiques

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Description

Cette séance de cours couvre la modélisation computationnelle et la conception de voies allostériques dynamiques dans les protéines, en mettant l'accent sur la reprogrammation de la signalisation des récepteurs membranaires et la repurposition des récepteurs dopamine D2 dans les biocapteurs de la sérotonine. Il traite de la diversité structurale des agonistes des récepteurs D2, de l'encodage des propriétés de commutation et du développement de biocapteurs GPCR à haute sensibilité et sélectivité.

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Concepts associés (32)

Signalisation cellulaire

La signalisation cellulaire est un système complexe de communication qui régit les processus fondamentaux des cellules et coordonne leur activité. La capacité des cellules à percevoir leur micro-environnement et à y répondre correctement est à la base de leur développement et de celui des organismes multicellulaires, de la cicatrisation et du système immunitaire, ainsi que de l'homéostasie tissulaire normale. Des dysfonctionnements dans le traitement de l'information cellulaire peuvent être responsables de maladies telles que le cancer, les maladies auto-immunes et le diabète.

Récepteur transmembranaire

Les récepteurs transmembranaires sont des protéines intégrales de membrane, qui résident et agissent typiquement au sein de la membrane plasmique de la cellule, mais aussi dans les membranes de quelques compartiments sous-cellulaires et organites. Leur association avec une (ou parfois deux) molécules d'un côté de la membrane produit une réaction de l'autre côté. À ce titre, ils jouent un rôle unique dans les communications entre les cellules et la transmission du signal.

Récepteur couplé aux protéines G

Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) sont une famille de récepteurs transmembranaires chez les mammifères. Parmi les nombreux récepteurs qui jouent un rôle dans la communication cellulaire, les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) constituent la plus grande famille de récepteurs membranaires de mammifères puisqu’elle représente 3,4 % du génome. Plus de la moitié des agents pharmacologiques agissent sur les RCPG : ils sont donc une classe de protéines d'importance thérapeutique majeure.

Protein fold class

In molecular biology, protein fold classes are broad categories of protein tertiary structure topology. They describe groups of proteins that share similar amino acid and secondary structure proportions. Each class contains multiple, independent protein superfamilies (i.e. are not necessarily evolutionarily related to one another). Four large classes of protein that are generally agreed upon by the two main structure classification databases (SCOP and CATH).

Prédiction de la structure des protéines

La prédiction de la structure des protéines est l'inférence de la structure tridimensionnelle des protéines à partir de leur séquences d'acides aminés, c'est-à-dire la prédiction de leur pliage et de leur structures secondaire et tertiaire à partir de leur structure primaire. La prédiction de la structure est fondamentalement différente du problème inverse de la conception des protéines. Elle est l'un des objectifs les plus importants poursuivis par la bioinformatique et la chimie théorique.

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Récepteurs couplés aux protéines G: bases et structures

Explore les bases et les structures des récepteurs couplés aux protéines G, couvrant les schémas de signalisation, les structures, le contexte historique, le ciblage des médicaments et les progrès récents.

Récepteurs couplés aux protéines G: Signalisation de la diversité et de la complexité

Explore la diversité et la complexité des récepteurs couplés aux protéines G, en se concentrant sur leurs voies de signalisation, leurs effets ligands et leur activité cellulaire.

Récepteurs couplés aux protéines G : Signalisation de la diversité

Explore la diversité de signalisation des récepteurs couplés aux protéines G, la structure de couverture, l'activation, les effets de biais et l'internalisation.

Machines à réparer les protéines: évolution et fonction

Explore l'évolution et la fonction des machines à réparer les protéines, en mettant l'accent sur le rôle des machines à déployer alimentées à l'ATP dans la prévention de l'agrégation des protéines et la promotion d'un pliage approprié.

Communication cellulaire: Signalisation des voies et des récepteurs

Déplacez-vous dans l'importance de la communication intercellulaire et des diverses voies de signalisation impliquées dans les réponses cellulaires.

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