Séance de cours

Analyse de projets de clonage

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Dans cours

CH-319: Experimental biochemistry and biophysics

A 7-week long (4+8 h) experiment where you plan and construct a fluorescent sensor protein starting from DNA bricks. The protein will be expressed in and purified from E.coli, characterized by biochemical and spectroscopic methods. Your report will be in ...

Description

Cette séance de cours couvre l'utilisation de ApE, un éditeur de plasmides, pour la planification et l'analyse de projets de clonage. Le contenu comprend des fonctionnalités telles que les ORF, les enzymes et les outils disponibles dans ApE, démontrés par l'analyse de diverses séquences et alignements.

Enseignant·e

Rudolf Hovius

Expertise Protein structure, expression & purificationÂ•Molecular interaction & receptor activationÂ•Fluorescence imaging & spectroscopySignalling & sensing Mission => Teaching: Lecture courses, tutorials and practicals in biochemistry, biophysical chemistry of membranes and signalling processes. Participating to the Commission d'Enseignement and Commission de l'Ecole Doctorale of Chemistry and Chemical Engineering.=> Research interests: Protein function and structure, Membrane protein (especially receptors

Source officielle

Concepts associés (31)

Outil

thumb|Une boîte à outils en bois des années 1950. Un outil est un objet physique utilisé par un être vivant directement, ou par l'intermédiaire d'une machine, afin d'exercer une action le plus souvent mécanique, ou thermique, sur un élément d'environnement à traiter (matière brute, objet fini ou semi-fini, être vivant, etc). Il améliore l'efficacité des actions entreprises ou donne accès à des actions impossibles autrement. Beaucoup procurent un avantage mécanique en fonctionnant selon le principe d'une machine simple, comme la pince-monseigneur, qui exploite le principe du levier.

Chimère (biologie moléculaire)

En génétique et en biologie moléculaire, une chimère correspond à une seule séquence d'ADN provenant de plusieurs transcriptions ou séquences parentes. Un tel résultat peut se produire dans divers contextes. Les chimères sont généralement considérées comme un contaminant, car une chimère peut être interprétée comme une nouvelle séquence alors qu'il s'agit en fait d'un artefact. Cependant, la formation de chimères artificielles peut également être un outil utile en biologie moléculaire.

Amorce (génétique)

En biologie moléculaire, l'amorce est une courte séquence d'ARN ou d'ADN, complémentaire du début d'une matrice, servant de point de départ à la synthèse du brin complémentaire de cette dernière matrice par une ADN polymérase. En PCR, l'utilisation d'une amorce "sens" et "anti-sens" permettent de définir la séquence de l'amplicon. En séquençage, on n'utilise qu'une seule des deux amorces du produit de PCR qu'on veut séquencer.

Plasmide

vignette|Schéma représentant une bactérie contenant des plasmides. En microbiologie et en biologie moléculaire, un plasmide est une molécule d'ADN distincte de l'ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la cellule. Les plasmides sont bicaténaires (constitués de deux brins complémentaires) et généralement circulaires. On les trouve presque exclusivement dans les bactéries et parfois dans d'autres micro-organismes comme le plasmide 2Mu que l'on trouve dans la levure Saccharomyces cerevisiae (levure de boulangerie), un eucaryote unicellulaire.

Enzyme de restriction

thumb|L'enzyme de restriction EcoRV (en vert) avec son substrat : l'ADN. Une enzyme de restriction est une protéine capable de couper un fragment d'ADN au niveau d'une séquence de nucléotides caractéristique appelée site de restriction. Chaque enzyme de restriction reconnaît ainsi un site spécifique. Plusieurs centaines d'enzymes de restriction sont actuellement connues. Naturellement présentes chez un grand nombre d'espèces de bactéries, ces enzymes sont devenues des outils importants en génie génétique.

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