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Séance de cours

Segments transmembranaires hélicoïdaux alpha

Dans cours

BIO-207: Cellular and molecular biology II

This course is aimed to familiarize students with the 3D organization of a eukaryotic cell, its compartmentalization, how cellular compartments communicate together and how a cell communicates with its environment. The related molecular mechanisms will be ...

Description

Cette séance de cours couvre la structure des hélices alpha dans les protéines transmembranaires, en se concentrant sur leur interaction avec les lipides et l'hydrophobicité. Il explique la prédiction des régions transmembranaires en utilisant la bioinformatique et l'indice d'hydrophobicité. L'instructeur discute d'exemples de protéines transmembranaires et de leurs structures asymétriques.

Enseignant·e·s (3)

Françoise Gisou van der Goot Grunberg

Gisou van der Goot est responsable du Laboratoire de Biologie Cellulaire et Membranaire et co-fondatrice de l'Institut dInfectiologie, à la Faculté des Sciences de la Vie de l'EPFL.Depuis 2021, Prof. van der Goot est Vice-présidente pour la transformation responsable, moteur du changement de l’EPFL vers une culture inclusive et un campus durable. De 2014 à 2020, Prof. van der Goot a occupé la fonction de Doyenne de cette même Faculté.Avant sa nomination à l'EPFL, en 2006, elle était Cheffe de Groupe à la Faculté des Sciences de lUniversité de Genève (UNIGE), puis Professeure Associée à la Faculté de Médecine. Prof. van der Goot a d'abord obtenu un diplôme dIngénieur de l'Ecole Centrale de Paris avant dentamer une thèse en Biophysique Moléculaire au CEA de Saclay (Université de Paris VI), suivie dun séjour postdoctoral au Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire (EMBL) à Heidelberg (Allemagne). Différentes distinctions lui ont été décernées, dont, en 2001, le Prix Young Investigator de l'EMBO (Organisation européenne de Biologie Moléculaire), puis, en 2005, le soutien par le programme international du Howard Hughes Medical Institute (HHMI, Etats-Unis); en 2009, elle a été la première femme à obtenir le Prix Marcel Benoist. La même année, elle est élue membre de lEMBO. Les domaines dexpertise du Prof. van der Goot incluent les mécanismes moléculaires et cellulaires des toxines bactériennes, l'organisation des membranes (des mammifères) et la biologie des organelles. Prof. van der Goot est membre du conseil scientifique de diverses organisations telles que le Fonds National Suisse de la Recherche Scientifique (SNF), le Conseil Suisse de la Science et de la Technologie (CSST) et le Conseil Européen de la Recherche (ERC).

Wouter Richard Karthaus

Romain Zufferey

Source officielle

Concepts associés (31)

Transmembrane domain

A transmembrane domain (TMD) is a membrane-spanning protein domain. TMDs may consist of one or several alpha-helices or a transmembrane beta barrel. Because the interior of the lipid bilayer is hydrophobic, the amino acid residues in TMDs are often hydrophobic, although proteins such as membrane pumps and ion channels can contain polar residues. TMDs vary greatly in size and hydrophobicity; they may adopt organelle-specific properties. Transmembrane domains are known to perform a variety of functions.

Protéine transmembranaire

Une protéine est dite transmembranaire lorsqu’elle traverse au moins une fois entièrement la membrane cellulaire. Il existe donc trois environnements de composition différente en contact avec la protéine : le milieu extracellulaire, les lipides de la membrane, le cytosol. Chacun de ces trois environnements a une influence sur la structure de la protéine. Les acides aminés qui composent la partie transmembranaire sont hydrophobes tandis que les acides aminés qui composent les parties extracellulaire et intracytosolique sont hydrophiles.

Bicouche lipidique

upright=1.33|vignette|Représentation d'une bicouche lipidique constituée de phosphoglycérides. Une bicouche lipidique, ou double couche lipidique, est une fine membrane polaire constituée de deux feuillets de molécules de lipides. Ces membranes forment une barrière continue autour des cellules et sont un élément essentiel assurant leur homéostasie, en régulant la diffusion des ions et des molécules à travers elle.

Radeau lipidique

Un radeau lipidique (en anglais, lipid raft) ou raft lipidique est un microdomaine de la membrane plasmique, riche en cholestérol, en sphingolipides et en DHA (Acide DocosaHexaénoïque). Il se caractérise par sa faible densité (flottabilité sur un gradient de densité) et son insolubilité dans des détergents doux, d'où l'autre nom technique parfois utilisé : detergent-resistant membrane. Ce sont des structures rigides dans la membrane et constituent des zones privilégiées pour l'activité de certaines protéines qui y sont intégrées.

Hydrophobie (physique)

L’hydrophobie (du grec υδρο, hydro = eau, et Φόβος, phóbos = répulsion) caractérise les surfaces qui semblent repousser l'eau. En réalité, il ne s'agit pas d'une réelle répulsion, mais plutôt du fait que l'eau étant une molécule polaire, elle a une très nette attirance préférentielle pour les autres molécules polaires, ce qui va amener ces molécules à s'assembler entre elles et former des billes qui semblent être repoussées par les molécules non polaires avec lesquelles elles n'ont pas une aussi forte affinité, alors qu'en réalité, ce sont les affinités entre les molécules polaires qui chassent vers l'extérieur de ces billes les molécules qui n'ont pas la même affinité avec elle - un peu de la même façon que le gradient de pression de l'eau chasse de son sein les corps moins denses (qui n'ont donc pas la capacité de générer en leur sein un gradient de pression aussi raide).

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Séances de cours associées (34)

Lipides et Membranes Cellulaires / Glucides

Explore les enzymes, l'évolution, les lipides, les membranes, les glucides, les protéines membranaires et les mécanismes d'inhibition des enzymes.

Mécanisme de mobilité transmembranaire des protéines

Explore la mobilité des protéines dans les membranes cellulaires, les expériences de fusion, les jonctions serrées, la ségrégation latérale et les méthodes de suivi.

Structure et fonction des membranes

Explore la composition et la fonction des membranes cellulaires, y compris les bicouches de phospholipides et les protéines transmembranaires.

Voies de transport intracellulaires

Couvre la classification précoce des organites dans deux voies de transport intracellulaires majeures et le transfert des lipides entre les compartiments cellulaires.

Dynamique membranaire : pores et agrégats

Discute de la dynamique d'auto-assemblage dans les systèmes huileux et lipidiques, en se concentrant sur la croissance globale et la formation de pores dans les bicouches lipidiques.

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