Protéomique quantitative: SILAC pour les interactions SM-Protéine

Cette séance de cours se transforme en protéomique quantitative à l'aide du SILAC pour identifier les interactions entre les petites molécules (SM) et les protéines. La conception expérimentale comprend l'étiquetage des acides aminés légers et lourds, l'incubation avec des billes chargées en SM et l'analyse des spectres MS. On discute des limites, des contrôles et des interprétations des résultats, ainsi que de l'importance de modèles de liaison spécifiques. Différents outils et concepts en biologie chimique sont explorés, notamment les inhibiteurs des enzymes, les méthodes d'identification des cibles et l'analyse des signaux au niveau des protéomes. Une étude de cas sur l'ABPP compétitive illustre l'application d'inhibiteurs covalents et d'ABPP dans l'étude de l'activité enzymatique et des protéomes cancéreux.