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Outils de biologie chimique : Inhibition des enzymes et modulation des cibles

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Description

Cette séance de cours porte sur les outils de biologie chimique liés à l'inhibition des enzymes, y compris les mécanismes réversibles (compétitifs, non concurrentiels, analogues TS) et irréversibles. Il traite également des techniques de modulation des cibles basées sur les petites molécules comme la méthode Bump-Hole et le profilage indirect ABPP. De plus, il explore les outils de transcriptome/probation des génomes tels que l'affichage de l'ARNm et les aptamères de l'ARN. La séance de cours se décline en outils d'analyse au niveau du protéome comme la technique de suppression Amber et la méthode SILAC-BONCAT, mettant en évidence leurs applications en biologie chimique.

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Proximité ontologique

Biologie

Biologie cellulaire: Métabolisme

Concepts associés (32)

Transcriptome

vignette|Puces à ADN employée pour analyser l'expression de gènes humains à gauche, de souris à droite. Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales.

Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de transcription d'un génome. Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du séquençage systématique d'ADN complémentaires. Métatransc

Inhibiteur enzymatique

thumb|upright=1.2|Complexe d'une protéase du VIH (rubans rouges, bleus et jaunes) associée à l'inhibiteur qu'est le ritonavir (petite structure en bâtons et boules près du centre). Un inhibiteur enzymatique est une substance se liant à une enzyme et qui en diminue l'activité. Un inhibiteur peut empêcher la fixation du substrat sur le site actif en se fixant à sa place, ou provoquer une déformation de l'enzyme qui rend celle-ci inactive (inhibiteur allostérique).

Cartographie génétique

alt=Genetic Difference|vignette|Cartographie génétique du monde selon les légères différences de locus La cartographie génétique est la construction d’une carte soit localisée autour d’un gène, soit à base large portant sur le génome entier. Plus généralement, c’est la détermination de la position d’un locus (gène ou marqueur génétique) sur un chromosome en fonction du taux de recombinaison génétique. Son unité de distance est le centimorgan (cM).

Séquençage shotgun

En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu.

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Séances de cours associées (64)

Cibler la Glycolyse et la Signalisation du cancer

Explore le ciblage de la glycolyse et des commutateurs de signalisation du cancer, les mécanismes d'inhibition des enzymes, et le rôle de l'ATP comme monnaie d'énergie de l'organisme.

Métabolisme : énergie et composés cellulaires

Explore le catabolisme, l'anabolisme, l'équilibre énergétique, la production d'ATP et les processus de respiration cellulaire.

Métabolisme du glucose: production d'ATP et chaîne de transport d'électrons

Explore le métabolisme des graisses et des sucres en acétyl-CoA et la production d'ATP à partir du glucose.

Glycolyse et cycle des Krebs

Explique la glycolyse, la fermentation, le cycle Krebs, la production d'ATP et la chaîne de transport d'électrons dans les mitochondries.

Synthèse d'ATP : Cycle de glycolyse et de Krebs

Explore la synthèse de l'ATP par la glycolyse, la fermentation, les voies d'oxydation et la phosphorylation oxydative dans les mitochondries.

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Transcriptome

Transcriptomique

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Séquençage shotgun

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