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Séance de cours

Outils de biologie chimique : Inhibition des enzymes et modulation des cibles

Description

Cette séance de cours porte sur les outils de biologie chimique liés à l'inhibition des enzymes, y compris les mécanismes réversibles (compétitifs, non concurrentiels, analogues TS) et irréversibles. Il traite également des techniques de modulation des cibles basées sur les petites molécules comme la méthode Bump-Hole et le profilage indirect ABPP. De plus, il explore les outils de transcriptome/probation des génomes tels que l'affichage de l'ARNm et les aptamères de l'ARN. La séance de cours se décline en outils d'analyse au niveau du protéome comme la technique de suppression Amber et la méthode SILAC-BONCAT, mettant en évidence leurs applications en biologie chimique.

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Proximité ontologique

Biologie

Biologie cellulaire: Métabolisme

Concepts associés (32)

Inhibiteur enzymatique

thumb|upright=1.2|Complexe d'une protéase du VIH (rubans rouges, bleus et jaunes) associée à l'inhibiteur qu'est le ritonavir (petite structure en bâtons et boules près du centre). Un inhibiteur enzymatique est une substance se liant à une enzyme et qui en diminue l'activité. Un inhibiteur peut empêcher la fixation du substrat sur le site actif en se fixant à sa place, ou provoquer une déformation de l'enzyme qui rend celle-ci inactive (inhibiteur allostérique).

Transcriptome

vignette|Puces à ADN employée pour analyser l'expression de gènes humains à gauche, de souris à droite. Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales.

Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de transcription d'un génome. Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du séquençage systématique d'ADN complémentaires. Métatransc

Inhibiteur compétitif

upright=1.25|vignette| L'inhibiteur peut se lier directement au site actif de l'enzyme, à la place du substrat. redresse=1.25|vignette| L'inhibiteur peut bloquer la liaison du substrat au site actif depuis un autre site de liaison sur l'enzyme par inhibition allostérique. redresse=1.25|vignette| L'inhibiteur peut bloquer le site catalytique depuis un site allostérique distinct. Un inhibiteur compétitif est un inhibiteur enzymatique qui agit en se liant à un site actif libre d'une enzyme à la place d'un substrat, ce qui bloque la réaction normalement catalysée par l'enzyme.

Non-competitive inhibition

Non-competitive inhibition is a type of enzyme inhibition where the inhibitor reduces the activity of the enzyme and binds equally well to the enzyme whether or not it has already bound the substrate. This is unlike competitive inhibition, where binding affinity for the substrate in the enzyme is decreased in the presence of an inhibitor. The inhibitor may bind to the enzyme whether or not the substrate has already been bound, but if it has a higher affinity for binding the enzyme in one state or the other, it is called a mixed inhibitor.

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Séances de cours associées (31)

Diversité métabolique : Fermentation et production d'énergie

Explore la diversité métabolique des microorganismes, en mettant l'accent sur les voies de fermentation et la production d'énergie.

Glycolyse et cycle des Krebs

Explique la glycolyse, la fermentation, le cycle Krebs, la production d'ATP et la chaîne de transport d'électrons dans les mitochondries.

Cycle de l'acide citrique: Aperçu

Fournit une exploration approfondie du cycle de l'acide citrique, en mettant l'accent sur la production, l'oxydation et la régulation de l'acétyl-CoA, ainsi que sur le processus d'oxydation et de transport des acides gras.

Voies métaboliques : diversité et fixation

Déplacez-vous dans les voies métaboliques, les composés riches en énergie et les processus de fermentation, en soulignant l'importance des biocarburants comme alternative aux combustibles fossiles.

Intégration du métabolisme: gluconéogenèse et glycolyse

Discute de l'intégration des voies métaboliques, en se concentrant sur la gluconéogenèse et la glycolyse, et leur régulation hormonale dans le maintien de l'homéostasie du glucose.

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Concepts associés (32)

Inhibiteur enzymatique

Transcriptome

Transcriptomique

Inhibiteur compétitif

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