Combinateur d'analyseursEn programmation informatique, un combinateur d'analyseurs est une fonction d'ordre supérieur qui accepte plusieurs analyseurs en entrée et renvoie un nouvel analyseur en sortie. Dans ce contexte, un analyseur est une fonction acceptant des chaînes en entrée et renvoyant une structure en sortie, généralement un arbre d'analyse ou un ensemble d'indices représentant les emplacements dans la chaîne où l'analyse s'est arrêtée avec succès.
Analyse syntaxiqueL' consiste à mettre en évidence la structure d'un texte, généralement une phrase écrite dans une langue naturelle, mais on utilise également cette terminologie pour l'analyse d'un programme informatique. L' (parser, en anglais) est le programme informatique qui réalise cette tâche. Cette opération suppose une formalisation du texte, qui est vue le plus souvent comme un élément d'un langage formel, défini par un ensemble de règles de syntaxe formant une grammaire formelle.
Recursive descent parserIn computer science, a recursive descent parser is a kind of top-down parser built from a set of mutually recursive procedures (or a non-recursive equivalent) where each such procedure implements one of the nonterminals of the grammar. Thus the structure of the resulting program closely mirrors that of the grammar it recognizes. A predictive parser is a recursive descent parser that does not require backtracking.
Top-down parsingTop-down parsing in computer science is a parsing strategy where one first looks at the highest level of the parse tree and works down the parse tree by using the rewriting rules of a formal grammar. LL parsers are a type of parser that uses a top-down parsing strategy. Top-down parsing is a strategy of analyzing unknown data relationships by hypothesizing general parse tree structures and then considering whether the known fundamental structures are compatible with the hypothesis.
Analyse EarleyEn théorie des langages, l'algorithme d'Earley est un algorithme d'analyse syntaxique pour les grammaires non contextuelles décrit pour la première fois par Jay Earley. À l'instar des algorithmes CYK et GLR, l'algorithme d'Earley calcule toutes les analyses possibles d'une phrase (et pas seulement une de ces analyses). Il repose sur de la programmation dynamique. On peut construire un analyseur Earley pour toute grammaire non contextuelle. Il s'exécute en temps cubique (O (n3), où n est la longueur de la chaîne d'entrée).
Parsing expression grammarIn computer science, a parsing expression grammar (PEG) is a type of analytic formal grammar, i.e. it describes a formal language in terms of a set of rules for recognizing strings in the language. The formalism was introduced by Bryan Ford in 2004 and is closely related to the family of top-down parsing languages introduced in the early 1970s. Syntactically, PEGs also look similar to context-free grammars (CFGs), but they have a different interpretation: the choice operator selects the first match in PEG, while it is ambiguous in CFG.
Shift-reduce parserA shift-reduce parser is a class of efficient, table-driven bottom-up parsing methods for computer languages and other notations formally defined by a grammar. The parsing methods most commonly used for parsing programming languages, LR parsing and its variations, are shift-reduce methods. The precedence parsers used before the invention of LR parsing are also shift-reduce methods. All shift-reduce parsers have similar outward effects, in the incremental order in which they build a parse tree or call specific output actions.
Comparison of parser generatorsThis is a list of notable lexer generators and parser generators for various language classes. Regular languages are a category of languages (sometimes termed Chomsky Type 3) which can be matched by a state machine (more specifically, by a deterministic finite automaton or a nondeterministic finite automaton) constructed from a regular expression.
Analyse lexicaleEn informatique, l’analyse lexicale, lexing, segmentation ou tokenization est la conversion d’une chaîne de caractères (un texte) en une liste de symboles (tokens en anglais). Elle fait partie de la première phase de la chaîne de compilation. Ces symboles sont ensuite consommés lors de l'analyse syntaxique. Un programme réalisant une analyse lexicale est appelé un analyseur lexical, tokenizer ou lexer. Un analyseur lexical est généralement combiné à un analyseur syntaxique pour analyser la syntaxe d'un texte.
Séquençage de l'ADNcadre|Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné. La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués.
SéquençageEn biochimie, le séquençage consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule (les acides aminés d'une protéine, les nucléotides d'un acide nucléique comme l'ADN, les monosaccharides d'un polysaccharide, etc.). En génétique, le séquençage concerne la détermination de la séquence des gènes voire des chromosomes, voire du génome complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.
Analyseur LRComme tout analyseur grammatical (ou analyseur syntaxique), un analyseur LR vise à vérifier si une chaîne de caractères (typiquement contenue dans un fichier) possède bien la structure d'une grammaire spécifiée à l'avance. Cette vérification s'accompagne généralement d'actions. Une action typique est la génération d'une autre chaîne de caractères ou encore d'un arbre d'analyse. Ainsi l'analyse grammaticale est généralement utilisée pour la compilation (transformation d'un code source en code machine).
Séquençage shotgunEn génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu.
Sanger sequencingSanger sequencing is a method of DNA sequencing that involves electrophoresis and is based on the random incorporation of chain-terminating dideoxynucleotides by DNA polymerase during in vitro DNA replication. After first being developed by Frederick Sanger and colleagues in 1977, it became the most widely used sequencing method for approximately 40 years. It was first commercialized by Applied Biosystems in 1986. More recently, higher volume Sanger sequencing has been replaced by next generation sequencing methods, especially for large-scale, automated genome analyses.
Exome sequencingExome sequencing, also known as whole exome sequencing (WES), is a genomic technique for sequencing all of the protein-coding regions of genes in a genome (known as the exome). It consists of two steps: the first step is to select only the subset of DNA that encodes proteins. These regions are known as exons—humans have about 180,000 exons, constituting about 1% of the human genome, or approximately 30 million base pairs. The second step is to sequence the exonic DNA using any high-throughput DNA sequencing technology.
Massive parallel sequencingMassive parallel sequencing or massively parallel sequencing is any of several high-throughput approaches to DNA sequencing using the concept of massively parallel processing; it is also called next-generation sequencing (NGS) or second-generation sequencing. Some of these technologies emerged between 1993 and 1998 and have been commercially available since 2005. These technologies use miniaturized and parallelized platforms for sequencing of 1 million to 43 billion short reads (50 to 400 bases each) per instrument run.
Whole genome sequencingWhole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing, complete genome sequencing, or entire genome sequencing, is the process of determining the entirety, or nearly the entirety, of the DNA sequence of an organism's genome at a single time. This entails sequencing all of an organism's chromosomal DNA as well as DNA contained in the mitochondria and, for plants, in the chloroplast. Whole genome sequencing has largely been used as a research tool, but was being introduced to clinics in 2014.
Scannerless parsingIn computer science, scannerless parsing (also called lexerless parsing) performs tokenization (breaking a stream of characters into words) and parsing (arranging the words into phrases) in a single step, rather than breaking it up into a pipeline of a lexer followed by a parser, executing concurrently. A language grammar is scannerless if it uses a single formalism to express both the lexical (word level) and phrase level structure of the language.
Scala (langage)Scala est un langage de programmation multi-paradigme conçu à l'École polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) pour exprimer les modèles de programmation courants dans une forme concise et élégante. Son nom vient de l'anglais Scalable language qui signifie à peu près « langage adaptable » ou « langage qui peut être mis à l'échelle ». Il peut en effet être vu comme un métalangage. Scala intègre les paradigmes de programmation orientée objet et de programmation fonctionnelle, avec un typage statique.
Flex (logiciel)Flex est une version libre de l'analyseur lexical Lex. Il est généralement associé à l'analyseur syntaxique GNU Bison, la version GNU de Yacc. Flex est un outil pour générer des analyseurs, programmes qui reconnaissent des motifs lexicaux dans du texte. Il lit les fichiers d'entrée donnés, ou bien son entrée standard si aucun fichier n'est donné, pour obtenir la description de l'analyseur à générer. La description est une liste de paires d'expressions rationnelles et de code C, appelées règles.
