Séance de cours

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

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Dans cours

CH-419: Protein mass spectrometry and proteomics

In systems biology, proteomics represents an essential pillar. The understanding of protein function and regulation provides key information to decipher the complexity of living systems. Proteomic technology now enables deep quantitative proteome mapping v ...

Description

Cette séance de cours couvre les principes de la chromatographie liquide, en se concentrant sur les facteurs affectant la résolution, la capacité et les pics asymétriques. Il explore également diverses techniques chromatographiques telles que l'adsorption, la phase inverse, l'échange d'ions et la chromatographie d'affinité. L'instructeur explique l'utilisation de la chromatographie liquide haute performance (HPLC) et ses composants, détecteurs et différentes configurations. En outre, la séance de cours traite de la chromatographie d'affinité métallique immobilisée (IMAC) et des avantages des capillaires et des nano-LC. La comparaison entre la chromatographie par focalisation isoélectrique (IEF) hors gel et la chromatographie par échange cationique fort (SCX) est explorée, soulignant leurs complémentarités pour une couverture protéomique en profondeur.

Enseignant·e

Loïc Dayon

Enseignement et PhD Cours Protein mass spectrometry and proteomics CH-419 L'analyse protéomique est un pilier essentiel de la biologie des systèmes, permettant une meilleure compréhension du vivant. Les technologies protéomiques, et en particulier celles basées sur la spectrométrie de masse, permettent désormais de cartographier les protéomes à large échelle.

Source officielle

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Chromatographie en phase liquide-spectrométrie de masse

La chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (en anglais Liquid chromatography-mass spectrometry ou LC-MS) est une méthode d'analyse qui combine les performances de la chromatographie en phase liquide et de la spectrométrie de masse afin d'identifier et/ou de quantifier précisément de nombreuses substances. Une unité LC-MS est composée de deux blocs principaux : un chromatographe en phase liquide et un spectromètre de masse. Catégorie:Méthode de la biochimie Catégorie:Chromatogra

Chromatographie

La chromatographie est une méthode physico-chimique qui sert à séparer les différentes substances présentes dans un mélange (échantillon en phase homogène liquide ou gazeuse). vignette|458x458px|Chromatographie sur couche mince faisant apparaître les composants d'une plante verte, comme la chlorophylle. Il est probable que la séparation de pigments inspira le nom de la méthode. L'appareil utilisé pour effectuer certaines chromatographies se nomme chromatographe. L'image ou le diagramme obtenu par chromatographie est appelé chromatogramme.

Chromatographie en phase liquide à haute performance

vignette|Un chromatographe en phase liquide à haute performance. De gauche à droite : un dispositif de pompage destiné à générer un gradient de deux solvants une colonne de chromatographie et un détecteur pour mesurer l'absorbance. vignette|Un chromatographe en phase liquide à haute performance moderne. La chromatographie en phase liquide à haute performance (CLHP) est une technique de séparation analytique et/ou préparatrice de molécules présentes dans un mélange.

Chromatographie sur colonne

thumb|Chromatographie sur colonne dans un laboratoire de la Food and Drug Administration dans les années 1950. La chromatographie sur colonne est fondée sur le même principe que la chromatographie sur couche mince, sauf que la silice ne se trouve pas sur une plaque mais dans une colonne. Cette technique est très utilisée dans la purification en chimie organique. La séparation des composés est provoquée par l'écoulement continu d'un éluant passant dans la colonne par gravité ou sous l'effet d'une faible pression.

Chromatographie sur papier

thumb|schéma d'une chromatographie sur papier thumb|Résultat d'une chromatographie de base sur papier filtre. Fait avec des feuilles d'épinard La chromatographie sur papier est une technique de chromatographie planaire dont la phase mobile est liquide. Pour effectuer une telle séparation, une petite quantité de la ou des solutions à analyser est déposée sur le bord d'une bande de papier de chromatographie. Cet échantillon est adsorbé par le papier ; ce qui signifie que les molécules interagissent avec ce dernier et qu'elles auront tendance à rester au même endroit.

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Réseaux neuronaux : Perceptrons multicouches

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Explorer les protéines: structure, purification et analyse

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