Séance de cours

Compilation du fichier Synapse NMODL.mod

Graph Chat

Chattez avec Graph Search

Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

Description

Cette séance de cours couvre le processus de compilation des fichiers NMODL.mod pour la modélisation synapse à l'aide de NEURON. L'instructeur montre comment utiliser 'nrnivmodl' pour compiler. fichiers mod, vérifier la compilation réussie, et tester le nouveau modèle de synapse. La séance de cours comprend également des instructions sur le chargement des modèles compilés, le dépannage des erreurs, et la création d'un neurone pour héberger la synapse.

Dans MOOC

Simulation de la neuroscience

Source officielle

Concepts associés (12)

Synapse

thumb|400px|Synapse entre deux neurones. La synapse (du grec , « contact, point de jonction », dérivé de , « joindre, connecter ») est une zone de contact fonctionnelle qui s'établit entre deux neurones, ou entre un neurone et une autre cellule (cellules musculaires, récepteurs sensoriels...). Elle assure la conversion d'un potentiel d'action déclenché dans le neurone présynaptique en un signal dans la cellule postsynaptique. On estime, pour certains types cellulaires (par exemple cellule pyramidale, cellule de Purkinje.

Neurosciences computationnelles

Les neurosciences computationnelles (NSC) sont un champ de recherche des neurosciences qui s'applique à découvrir les principes computationnels des fonctions cérébrales et de l'activité neuronale, c'est-à-dire des algorithmes génériques qui permettent de comprendre l'implémentation dans notre système nerveux central du traitement de l'information associé à nos fonctions cognitives. Ce but a été défini en premier lieu par David Marr dans une série d'articles fondateurs.

Neurosciences

thumb|250px|Dessin de neurones du cervelet de pigeon par Santiago Ramón y Cajal (1899). Les neurosciences sont les études scientifiques du système nerveux, tant du point de vue de sa structure que de son fonctionnement, depuis l'échelle moléculaire jusqu'au niveau des organes, comme le cerveau, voire de l'organisme tout entier. Le champ de la recherche en neurosciences est un champ transdisciplinaire : la biologie, la chimie, les mathématiques, la bio-informatique ainsi que la neuropsychologie sont utilisées en neurosciences.

Electrical synapse

An electrical synapse is a mechanical and electrically conductive link between two neighboring neurons that is formed at a narrow gap between the pre- and postsynaptic neurons known as a gap junction. At gap junctions, such cells approach within about 3.8 nm of each other, a much shorter distance than the 20- to 40-nanometer distance that separates cells at chemical synapse. In many animals, electrical synapse-based systems co-exist with chemical synapses.

Neurone

thumb|537x537px|Schéma complet d’un neurone. Un neurone, ou une cellule nerveuse, est une cellule excitable constituant l'unité fonctionnelle de la base du système nerveux. Les neurones assurent la transmission d'un signal bioélectrique appelé influx nerveux. Ils ont deux propriétés physiologiques : l'excitabilité, c'est-à-dire la capacité de répondre aux stimulations et de convertir celles-ci en impulsions nerveuses, et la conductivité, c'est-à-dire la capacité de transmettre les impulsions.

Afficher plus

Séances de cours associées (38)

L'informatique scientifique en neurosciences

Explore l'histoire et les outils de l'informatique scientifique en neuroscience, en mettant l'accent sur la simulation des neurones et des réseaux.

Qualité des modèles d'intégration et d'incendie MOOC: Dynamique neuronale - Neuroscience computationnelle des neurones uniques

Explore la qualité des modèles Integrate-and-Fire dans les neurosciences computationnelles par des comparaisons avec des données expérimentales et des prédictions mathématiques.

Dendrite comme un câble MOOC: Dynamique neuronale - Neuroscience computationnelle des neurones uniques

Discute des dendrites comme des câbles, couvrant la dérivation de l'équation de câble et la conservation du courant dans les compartiments couplés.

Modèles électriques monocellulaires: passifs MOOC: Simulation de la neuroscience

Couvre la construction de modèles électriques monocellulaires utilisant NEURON, y compris les paramètres de réglage, les simulations de fonctionnement et la modélisation des courants transmembranaires.

Modèles CA1 monocellulaires MOOC: Simulation d'un micro-circuit d'hippocampe

Explore les propriétés particulières, la variabilité, l'optimisation et la dégénérescence des neurones CA1.

Afficher plus

Concepts associés (12)

Synapse

Neurosciences computationnelles