Henning Paul-Julius StahlbergPositions:
Since 2020 Prof. Physics, IPHYS, SB, EPFL, Switzerland 2009 – 2021 Prof. Structural Biology, Biozentrum, University Basel, Switzerland
2009 – 2010 Adj. Assoc. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
2007 – 2009 Assoc. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
2003 – 2007 Assist. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
Education: 2002 Habilitation, Biozentrum, University Basel, Switzerland 1997 – 2003 Postdoctoral Fellow, Biozentrum, University Basel, Switzerland 1992 – 1997 PhD Student, EPFL, Lausanne, Switzerland 1990 – 1991 Diploma Thesis in Solid State Physics, TU Berlin, Germany 1987 – 1993 Study of Physics, TU Berlin, Germany Selected Awards & Honors: 2009 W.M.Keck Award 2004 CAREER award, NSF, USA 2002 Habilitation, University Basel, Switzerland Selected Memberships: 2008 – 2013 Chancellor’s Fellow Award, UC Davis, CA, USA 2004 – 2009 Faculty of 1000 Since 1992 Swiss Society for Optics and Microscopy (SSOM)
Anne-Laure Mahul MellierExpertise
Cellular Biology: Cell culture of mammalian cell lines (U2OS, N2a, M17, SH-S5Y5, Cos, HeLa, HEK, MCF7), Astrocytic and neuronal primary cultures (hippocampus, cortex, striatum, midbrain) from P0 mouse or rat pups or from E16-E19 mice embryos, iPSC neuronal cultures (proliferation, passaging, differentiation in iNeurons or iDopaminergic neurons), Cellular transfection (DNA plasmid, siRNA, shRNA), Lentiviruses production and infection of neuronal primary cultures or mammalian cell lines, Samples pre
Christian IseliExpertise
BioinformatiqueComputer engineering
Enseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics
Nicolas Jean Philippe GuexEnseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics in biomedical research BIOENG-519
Marion LeleuExpertise
BioinformaticsGenomicsHight-Throughput SequencingData Mining
Alessandro BarducciEnseignement et PhD A co-dirigé les thèses EPFL de Salvatore Assenza, Duccio Malinverni
Paolo De Los RiosEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les María Li López Bautista, Subhasis Dehury, Lisa Gennai A dirigé les thèses EPFL de Giovanni Salvi, Thomas Petermann, David Gfeller, Cécile Caretta Cartozo, David Morton de Lachapelle, Carlo Maffi, Lucio Floretta, Salvatore Assenza, Duccio Malinverni, Alberto Stefano Sassi, Andrea Martini, Solange Flatt, Adélaïde Alice Mohr, Shiling Liang, Alexandra Shelest, Davide Cois A co-dirigé les thèses EPFL de Lorenzo Talamanca Cours EDCB seminar series BIOENG-606
Tomislav MilekovicMission
Develop and advance brain-computer interfaces - devices that allow people with paralysis to control computers, robotic hands or their own paralyzed muscles directly by their brain activity - for the purpose of helping people with paralysis regain their lost abilities.
I obtained my dipl. ing. degree in Physics (equivalent to MSc in Physiscs) from the Faculty of Science of the Zagreb University in July 2006. During my undergraduate studies, I was awarded the Best Student award of the Department of Ph
Georges WagnièresGeorges Wagnières a obtenu son diplôme (MSc) en physique à l'Université de Lausanne, Suisse, en 1986. Il a reçu son doctorat ès science (PhD) en physique (Optique Biomédicale) de l'Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) en 1992, et a effectué un travail de postdoctorat dans les "Wellman Laboratories of Photomedicine" (Harvard Medical School) situés à Boston, MA, USA, en 1993 et 1994. Il a aussi obtenu, en 2001, un "Master in management of technology" délivré par l'Ecole des Hautes Etudes Commerciales (HEC) de l'Université de Lausanne et l'EPFL. Depuis 1994, il gère un groupe de recherche de l'EPFL actif dans les domaines suivants: - Caractérisation et détection de lésions cancéreuses par spectroscopie et imagerie de fluorescence ainsi que par imagerie à fort grossissement. - Traitement du cancer ainsi que d'autres pathologies associées à des désordres immunologiques (maladie de Crohn, Colite ulcéreuse) ou vasculaires par thérapie photodynamique (PDT). - Développement préclinique et clinique de photosensibilisateurs, de marqueurs fluorescents et d'instruments optiques pour le photodiagnostic. - Traitement de diverses pathologies, y compris les maladies neuro-dégénératives (Parkinson, Alzheimer), par photobiomodulation. - Monitorage de la dose optique pour la PDT basée sur l'imagerie de fluorescence de photosensibilisateurs. - Induction de l'extravasation d'agent chimiothérapeutiques par PDT. - Mesure in vivo de la concentration d'oxygène dans des tissus biologiques par spectroscopie et imagerie optiques résolues en temps. - Monitorage d'un traitement au laser de la rétine par imagerie de reflectance. - Développement de distributeurs de lumière pour des applications biomédicales. - Dosimétrie de lumière / Radiométrie. - Spectroscopie et imagerie en optique biomédicale. Georges Wagnières est aussi co-fondateur et a présidé une société "spin-off" de l'EPFL: - Medlight SA, fondée en 1997, qui développe, produit et commercialise des distributeurs de lumière pour la thérapie photodynamique. Georges Wagnières est l'auteur et co-auteur de plus de 235 articles scientifiques dont 150 ont été publiés dans des revues internationales ayant un comité de relecture (review board). De plus, il est inventeur de 18 brevets. Finalement, il supervise ou a supervisé 12 doctorants et enseigne actuellement à l'EPFL l'optique biomédicale et la photomédecine au niveaux "master". Ces cours sont aussi donnés à l'Ecole doctorale (EDCH, EDSV) de l'EPFL. Finalement, il donne le cours intitulé "Physique Générale I" aux biologistes de première année inscrits à l'Ecole de Biologie de l'Université de Lausanne. PUBLICATIONS PRINCIPALES: SVP visiter: https://www.epfl.ch/labs/lifmet/wagnieres/publications/ Graham KnottEnseignement et PhD Cours Methods: from disease models to therapy BIOENG-518 Ce cours décrira les méthodes qui sont à la base des approches translationnelles depuis la génération et la caractérisation des modèles des maladies jusqu'aux applications thérapeutiques. Les bases théoriques seront complétées par des rotations pratiques dans les plateformes technologiques.
Bernard SchneiderEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Yesica Gloria, Christian Schellhaas A dirigé les thèses EPFL de Vanessa Laversenne, Sameer Mohammad Khaleel Nazeeruddin, Emma Charlotta Källstig A co-dirigé les thèses EPFL de Philippe Guillaume Coune, Emilda Pino, Elisabeth Anne Dirren, Aurélien Lathuilière, Wojciech Janusz Bobela, Lu Zheng, Cylia Cloé Rochat Cours Methods: from disease models to therapy BIOENG-518 Ce cours décrira les méthodes qui sont à la base des approches translationnelles
Michaël UnserExpertise
Image Processing Medical Imaging Biological Imaging Wavelets Splines Multiresolution
Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Youssef Haouchat, Vincent Patrick Lawrence Guillemet, Bassam El Rawas, Stanislas Ducotterd, Mehrsa Pourya, Zhiyuan Hu A dirigé les thèses EPFL de Stefan Horbelt, Jan Kybic, Maria Arrate Munoz Barrutia, Manuela Feilner, Slavica Jonic, Mathews Jacob, Michael Liebling, Michael Sühling, Muthuvel Arigovindan, François Aguet, Cédric Vonesch, Ildar Khalidov, Sathish Ramani, F
Daniel SageExpertise
Publications
Enseignement et PhD A co-dirigé les thèses EPFL de Daniel Andreas Schmitter, Anaïs Badoual, Laurène Donati Cours Bioimage informatics BIO-410 Le cours fournit une complète revue des méthodes, algorithmes et des outils logiciels utilisés en analyse d'images biologiques. Il expose les concepts fondamentaux et les solutions informatiques permettant d'extraire des informations quantitatives à partir d'images multidimensionnelles. Fundamentals of Image Analysis EE
