Rolf GruetterAwards:
1999 Young Investigator Award Plenary Lectureship
, International Society for Neurochemistry
2011 Fellow
, ESMRMB
2011 Teaching Award
, Section Sciences de la Vie, EPFL
Mahmut Selman SakarEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Lorenzo Francesco John Noseda, Nikita Norkin, Elif Ezgi Inan, Houman Javaheri, Mehdi Ali Gadiri, Julian Leon Raub, Junsun Hwang A dirigé les thèses EPFL de Erik Mailand, Raquel Filipa Penacho Parreira, Murat Kaynak, Lucio Pancaldi-Giubbini, Fazil Emre Uslu, Matthias Rüegg, Ece Özelçi, Emilie Vuille-Dit-Bille A co-dirigé les thèses EPFL de Laura Joan Hermans, Sourabh Monnappa Kuppanda Jafri Cours Dynamical systems ME-221 Introduction à la modélisa
Cristina Ramona Cudalbu MoldovanCristina Cudalbu obtained her Bachelors of Science degree in Medical Physics in 2002 and Masters of Science degree in Biophysics and Medical Physics in 2003, both from University Babes-Bolyai, Cluj-Napoca, Romania. In 2006 she obtained her PhD degree in Localized Proton MRS and time domain quantification of cerebral metabolites at 7T and 4.7T at University Lyon 1, RMN Laboratory, Villeurbanne, France.In 2007, she joined, as a Scientist, the Laboratory for Functional and Metabolic Imaging at EPFL, where she implemented new acquisition and quantification techniques for in vivo nitrogen, proton and carbon MRS for preclinical studies. Starting 2012, Cristina Cudalbu was appointed as Research Staff Scientist and 9.4T MRI Operational Manager at Centre d’Imagerie Biomédicale (CIBM) at EPFL. She is now developing new research lines at CIBM, being oriented towards new acquisition and quantification techniques for in vivo proton, phosphorous, carbon, nitrogen MRS and fast MRSI, diffusion weighted spectroscopy and brain macromolecules quantification. She is now applying these developments on chronic hepatic encephalopathy, a research area that she developed at CIBM (https://actu.epfl.ch/news/when-liver-disease-affects-the-brain/), and on different collaborative projects with researchers from the five partner institutions of CIBM. Anne-Laure Mahul MellierExpertise
Cellular Biology: Cell culture of mammalian cell lines (U2OS, N2a, M17, SH-S5Y5, Cos, HeLa, HEK, MCF7), Astrocytic and neuronal primary cultures (hippocampus, cortex, striatum, midbrain) from P0 mouse or rat pups or from E16-E19 mice embryos, iPSC neuronal cultures (proliferation, passaging, differentiation in iNeurons or iDopaminergic neurons), Cellular transfection (DNA plasmid, siRNA, shRNA), Lentiviruses production and infection of neuronal primary cultures or mammalian cell lines, Samples pre
Christian IseliExpertise
BioinformatiqueComputer engineering
Enseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics
Nicolas Jean Philippe GuexEnseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics in biomedical research BIOENG-519
Georges WagnièresGeorges Wagnières a obtenu son diplôme (MSc) en physique à l'Université de Lausanne, Suisse, en 1986. Il a reçu son doctorat ès science (PhD) en physique (Optique Biomédicale) de l'Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) en 1992, et a effectué un travail de postdoctorat dans les "Wellman Laboratories of Photomedicine" (Harvard Medical School) situés à Boston, MA, USA, en 1993 et 1994. Il a aussi obtenu, en 2001, un "Master in management of technology" délivré par l'Ecole des Hautes Etudes Commerciales (HEC) de l'Université de Lausanne et l'EPFL. Depuis 1994, il gère un groupe de recherche de l'EPFL actif dans les domaines suivants: - Caractérisation et détection de lésions cancéreuses par spectroscopie et imagerie de fluorescence ainsi que par imagerie à fort grossissement. - Traitement du cancer ainsi que d'autres pathologies associées à des désordres immunologiques (maladie de Crohn, Colite ulcéreuse) ou vasculaires par thérapie photodynamique (PDT). - Développement préclinique et clinique de photosensibilisateurs, de marqueurs fluorescents et d'instruments optiques pour le photodiagnostic. - Traitement de diverses pathologies, y compris les maladies neuro-dégénératives (Parkinson, Alzheimer), par photobiomodulation. - Monitorage de la dose optique pour la PDT basée sur l'imagerie de fluorescence de photosensibilisateurs. - Induction de l'extravasation d'agent chimiothérapeutiques par PDT. - Mesure in vivo de la concentration d'oxygène dans des tissus biologiques par spectroscopie et imagerie optiques résolues en temps. - Monitorage d'un traitement au laser de la rétine par imagerie de reflectance. - Développement de distributeurs de lumière pour des applications biomédicales. - Dosimétrie de lumière / Radiométrie. - Spectroscopie et imagerie en optique biomédicale. Georges Wagnières est aussi co-fondateur et a présidé une société "spin-off" de l'EPFL: - Medlight SA, fondée en 1997, qui développe, produit et commercialise des distributeurs de lumière pour la thérapie photodynamique. Georges Wagnières est l'auteur et co-auteur de plus de 235 articles scientifiques dont 150 ont été publiés dans des revues internationales ayant un comité de relecture (review board). De plus, il est inventeur de 18 brevets. Finalement, il supervise ou a supervisé 12 doctorants et enseigne actuellement à l'EPFL l'optique biomédicale et la photomédecine au niveaux "master". Ces cours sont aussi donnés à l'Ecole doctorale (EDCH, EDSV) de l'EPFL. Finalement, il donne le cours intitulé "Physique Générale I" aux biologistes de première année inscrits à l'Ecole de Biologie de l'Université de Lausanne. PUBLICATIONS PRINCIPALES: SVP visiter: https://www.epfl.ch/labs/lifmet/wagnieres/publications/ Pascal FuaPascal Fua received an engineering degree from Ecole Polytechnique, Paris, in 1984 and the Ph.D. degree in Computer Science from the University of Orsay in 1989. He then worked at SRI International and INRIA Sophia-Antipolis as a Computer Scientist. He joined EPFL in 1996 where he is now a Professor in the School of Computer and Communication Science and heads the Computer Vision Laboratory. His research interests include shape modeling and motion recovery from images, analysis of microscopy images, and Augmented Reality. His research interests include shape modeling and motion recovery from images, analysis of microscopy images, and machine learning. He has (co)authored over 300 publications in refereed journals and conferences. He is an IEEE Fellow and has been an Associate Editor of IEEE journal Transactions for Pattern Analysis and Machine Intelligence. He often serves as program committee member, area chair, and program chair of major vision conferences and has cofounded three spinoff companies (Pix4D, PlayfulVision, and NeuralConcept).
Graham KnottEnseignement et PhD Cours Methods: from disease models to therapy BIOENG-518 Ce cours décrira les méthodes qui sont à la base des approches translationnelles depuis la génération et la caractérisation des modèles des maladies jusqu'aux applications thérapeutiques. Les bases théoriques seront complétées par des rotations pratiques dans les plateformes technologiques.
