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Concept

Molecular design software

Molecular design software is notable software for molecular modeling, that provides special support for developing molecular models de novo.

Source officielle

https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_design_software

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MSE-305: Introduction to atomic-scale modeling

This course provides an introduction to the modeling of matter at the atomic scale, using interactive Jupyter notebooks to see several of the core concepts of materials science in action. ...

ChE-605: AI in chemistry and beyond: Highlights in the field

Should have expertise in chemistry, physics or lite and material sciences. Although a very good knowledge in Al-based algorithms is required to fully understand the technical details, a basic knowledge is sufficient to understand the potential of these met ...

MSE-468: Atomistic and quantum simulations of materials

Theory and application of quantum simulations to model, understand, and predict the properties of real materials. ...

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Séances de cours associées (32)

Modèles de génération profonde dans la découverte de médicaments

Explore l'application de modèles générateurs profonds dans la découverte de médicaments, en mettant l'accent sur la conception de petites molécules et l'optimisation des structures moléculaires.

Dynamique moléculaire sous contraintes

Explore les simulations de dynamique moléculaire sous des contraintes holonomiques, en se concentrant sur l'intégration numérique et la formulation d'algorithmes.

Équation de Schrdinger dépendante du temps: Base Set Solutions

Explore des solutions de base pour l'équation de Schrdinger dépendante du temps avec un hamiltonien dépendant du temps, y compris des cas spéciaux comme les paquets d'ondes gaussiennes.

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Publications associées (31)

Machine learning-aided generative molecular design

Philippe Schwaller, Jeff Guo

Machine learning has provided a means to accelerate early-stage drug discovery by combining molecule generation and filtering steps in a single architecture that leverages the experience and design preferences of medicinal chemists. However, designing mach ...

Nature Portfolio2024

Augmented Memory: Sample-Efficient Generative Molecular Design with Reinforcement Learning

Philippe Schwaller, Jeff Guo

Sample efficiency is a fundamental challenge in de novo molecular design. Ideally, molecular generative models should learn to satisfy a desired objective under minimal calls to oracles (computational property predictors). This problem becomes more apparen ...

Amer Chemical Soc2024

Solvation Free Energies from Machine Learning Molecular Dynamics

Nicola Marzari, Nicéphore Arthur François Bonnet

The present work proposes an extension to the approach of [Xi, C; et al. J. Chem. Theory Comput. 2022, 18, 6878] to calculate ion solvation free energies from first-principles (FP) molecular dynamics (MD) simulations of a hybrid solvation model. The approa ...

Amer Chemical Soc2024

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Unités associées (2)

Laboratoire de science computationnelle et modélisation

IMX - Gestion

Molecular design software is notable software for molecular modeling, that provides special support for developing molecular models de novo.

Source officielle

https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_design_software

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Concepts associés (18)

Comparison of software for molecular mechanics modeling

This is a list of computer programs that are predominantly used for molecular mechanics calculations.

Comparison of force-field implementations

This is a table of notable computer programs implementing molecular mechanics force fields.

Champ de force (chimie)

vignette|Un champ de force peut par exemple être utilisé afin de minimiser l'énergie d'étirement de cette molécule d'éthane. Dans le cadre de la mécanique moléculaire, un champ de force est un ensemble de potentiels et de paramètres permettant de décrire la structure de l'énergie potentielle d'un système de particules (typiquement, des atomes, mais non exclusivement). L'usage de l'expression champ de force en chimie et biologie numériques diffère ainsi de celui de la physique, où il indique en général un gradient négatif d'un potentiel scalaire.

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