Giovanna AmbrosiniCurrent Position Senior Scientist, School of Life Sciences, Bioinformatics Competence Center, école Polythechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne.Senior bioinformatician and software engineer with proven experience working in higher education institutions. Solid experience in scientific computing and web design. Proficient in physics and computational genomics, with a focus on high-throughput genomic sequencing data analysis (ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, scRNA-seq, and exome sequencing) and other types of
Marion LeleuExpertise
BioinformaticsGenomicsHight-Throughput SequencingData Mining
Christian HeinisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Thomas Julien Denis Emel, Alessandro Scapozza, Nathan Moïse De Sadeleer, Florian Handel, Hugo André Clerc, Frédéric Brantschen, Grégoire Menoud, Ines Michrafy, Jonathan Schmitt, Laura Elena Massaad A dirigé les thèses EPFL de Jeremy Touati, Shiyu Chen, Sophie Venet-Bonnot, Lisa Pollaro, Inmaculada Rentero Rebollo, Philippe Diderich, Charlotte Urech-Varenne, Silvia Bellotto, Davide Bertoldo, Alessandro Zorzi, Camille Villequey, Jonas Alfred Karl Wilbs, Grigory Ka
Anne-Florence Raphaëlle BitbolI was trained in physics, and always had a strong interest in biology. I am broadly interested in understanding biological phenomena in a quantitative way, through physical concepts and mathematical and computational tools. I investigate the relative impacts of optimization and historical contingency in biological evolution, both at the scale of protein sequences and at the scale of microbial populations.Here is my research group website.Curriculum vitae Here is my complete CV. Professional experience:Since
Stewart ColeProfessor Stewart Cole is an international authority in bacterial molecular-genetics and genomics. He has made outstanding contributions in several fields including: bacterial anaerobic electron transport; genome analysis of retroviruses and papillomaviruses; antibiotic resistance mechanisms; and the molecular microbiology of toxigenic clostridia. His studies on isoniazid and multidrug resistance in Mycobacterium tuberculosis, together with his pioneering work on the pathogenicity, evolution and genomics of the tubercle and leprosy bacilli, have made him an undisputed leader in the field of mycobacterial research. The findings of his research are of direct relevance to public health and disease-control in both the developing world and the industrialised nations. He has published over 250 scientific papers and review articles, and holds many patents.
Stephan MorgenthalerEDUCATION
Ph.D., Statistics, Princeton University, Princeton, 1983
Diplôme, Mathématiques, Ecole polytechnique fédérale de Zurich, 1979
CARRIÈRE ACADEMIQUE
Professeur de statistique appliquée, EPFL, 1991-présent
Professeur extraordinaire, statistique appliquée, EPFL, 1988-1991
Professeur associé, statistique, Yale University, 1987-1988
Professeur assistant, statistique, Yale University, 1984-1987
Instructor, mathématiques, Massachusetts Institute of Technology, 1983-1984
Stéphane JoostPublications Publications- List of publications
Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Marco André Vieira Ruas, Manon Laetitia Pribille, Martine Valérie Besse A dirigé les thèses EPFL de Estelle Rochat, Solange Catherine Gaillard, Oliver Michele Selmoni, Anaïs Ladoy, Annie Sandrine Guillaume A co-dirigé les thèses EPFL de Sylvie Stucki, Kevin Leempoel, Martí Bosch Padrós, Andrea Salmi Cours Border Forensics PENS-318 Le cours présentera aux étudiants différentes formes de violence liée
Jieping ZhuEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Morgane Elodie Marie Delattre, Paul Jean Gri, Clément Paul Adrien Rols, Yun Hao Shawn Teh A dirigé les thèses EPFL de Jean-Baptiste Gualtierotti, Ala Bunescu, Thomas Buyck, Olivier Wagnières, Minh Tu Ha, Dylan Jean Robert Dagoneau, Antonin François Roland Clemenceau, Cyril Piemontesi, Nicolas David Gaeng, Mathias Mamboury, Raphaël Beltran, Balázs Budai, Teerawat Songsichan, Alexandre Julien Florent Leclair, Bastien Delayre, Rémi Julien Sylvain Andres, Dina Boyar
Johan AuwerxEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Wenyu Liu, Maria Boulougouri, Giacomo Vincenzo Giorgio Von Alvensleben A dirigé les thèses EPFL de Pénélope Andreux, Mitsunori Nomura, Evan Graehl Williams, Hongbo Zhang, Virginija Jovaisaite, Elena Katsyuba, Karim Laurent Gariani, Adrienne Joëlle Laurence Mottis, Hao Li, Peiling Luan, Alexis Bachmann, Mario Romani, Xiaoxu Li, Alessia De Masi, Amélia Lalou A co-dirigé les thèses EPFL de Serge Thanh Son Ducommun, Laura Lukjanenko, Joanna Ratajczak, Angélique Sato
Henning Paul-Julius StahlbergPositions:
Since 2020 Prof. Physics, IPHYS, SB, EPFL, Switzerland 2009 – 2021 Prof. Structural Biology, Biozentrum, University Basel, Switzerland
2009 – 2010 Adj. Assoc. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
2007 – 2009 Assoc. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
2003 – 2007 Assist. Prof. Molecular & Cellular Biology, UC Davis, CA, USA
Education: 2002 Habilitation, Biozentrum, University Basel, Switzerland 1997 – 2003 Postdoctoral Fellow, Biozentrum, University Basel, Switzerland 1992 – 1997 PhD Student, EPFL, Lausanne, Switzerland 1990 – 1991 Diploma Thesis in Solid State Physics, TU Berlin, Germany 1987 – 1993 Study of Physics, TU Berlin, Germany Selected Awards & Honors: 2009 W.M.Keck Award 2004 CAREER award, NSF, USA 2002 Habilitation, University Basel, Switzerland Selected Memberships: 2008 – 2013 Chancellor’s Fellow Award, UC Davis, CA, USA 2004 – 2009 Faculty of 1000 Since 1992 Swiss Society for Optics and Microscopy (SSOM)
Arnaud BertschExpertise
MicrostereolithographiePhotopolymersMicrofabrication
Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Tao Zhang, Pol Torres Vila, Nicolas Bruno Minazzo A co-dirigé les thèses EPFL de Joan Teixidor, Clémentine Sophie Sarah Lipp, Nicolas Grégoire Maïno, Jiande Zhou, Jongeon Park Cours Advanced microfabrication practicals MICRO-373 Ce TP permet une formation approfondie sur les méthodes avancées de micro et nanofabrication dans un environnement de salle blanche pour des applications séle
Edgard Gnansounou
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1983 Ing. Civil EPFL
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1991 Dr ès Sciences techniques, EPFL
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Directeur du Laboratoire de systèmes énergétiques (LASEN) de 2003 à 2008
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Dès 2008, Responsable du groupe de Recherche en Bioénergie et Planification énergétique
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Co-fondateur du bureau d'étude ENERS Energy Concept
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Président de la Fondation SUD (Solidarités Universitaires pour le Développement)
Je suis membre de différentes associations professionnelles parmi lesquelles figuent le Conseil Mondial de l'énergie (CME) et l'Association internationale pour l'économie de l'énergie (AIEE). Comme membre du groupe d'étude du CME sur les vulnérabilités, j'ai développé les métriques utilisées pour évaluer la vulnérabilité énergétique des pays industrialisés.
Depuis janvier 2008 : membre du Comité d'édition du journal international Bioresource Technology.
Depuis 2009: membre du Comité de la "European Biofuels Technology Platform" David Atienza AlonsoDavid Atienza Alonso is an associate professor of EE and director of the Embedded Systems Laboratory (ESL) at EPFL, Switzerland. He received his MSc and PhD degrees in computer science and engineering from UCM, Spain, and IMEC, Belgium, in 2001 and 2005, respectively. His research interests include system-level design methodologies for multi-processor system-on-chip (MPSoC) servers and edge AI architectures. Dr. Atienza has co-authored more than 350 papers, one book, and 12 patents in these previous areas. He has also received several recognitions and award, among them, the ICCAD 10-Year Retrospective Most Influential Paper Award in 2020, Design Automation Conference (DAC) Under-40 Innovators Award in 2018, the IEEE TCCPS Mid-Career Award in 2018, an ERC Consolidator Grant in 2016, the IEEE CEDA Early Career Award in 2013, the ACM SIGDA Outstanding New Faculty Award in 2012, and a Faculty Award from Sun Labs at Oracle in 2011. He has also earned two best paper awards at the VLSI-SoC 2009 and CST-HPCS 2012 conference, and five best paper award nominations at the DAC 2013, DATE 2013, WEHA-HPCS 2010, ICCAD 2006, and DAC 2004 conferences. He serves or has served as associate editor of IEEE Trans. on Computers (TC), IEEE Design & Test of Computers (D&T), IEEE Trans. on CAD (T-CAD), IEEE Transactions on Sustainable Computing (T-SUSC), and Elsevier Integration. He was the Technical Program Chair of DATE 2015 and General Chair of DATE 2017. He served as President of IEEE CEDA in the period 2018-2019 and was GOLD member of the Board of Governors of IEEE CASS from 2010 to 2012. He is a Distinguished Member of ACM and an IEEE Fellow.
Benoît Jean Dominique FerrariBiologiste et biochimiste de formation, Benoît J.D. Ferrari a obtenu son diplôme de doctorat en Ecotoxicologie à lUniversité de Lorraine (Metz, France) en 2000 en travaillant sur le développement dune approche dévaluation du danger écotoxique des déchets solides utilisant une batterie de bioessais dans le cadre dun projet interdisciplinaire suivi par lAgence de lEnvironnement et de la Maîtrise de lEnergie (ADEME). Après avoir passé presque 7 années à Irstea (anciennement Cemagref) à Lyon en France (périodes 2000-2002 et 2008-2013) et avoir occupé un poste de Maitre-assistant à lInstitut F.A. Forel à Genève (2002-2008), il a acquis au travers des projets franco-suisses et européens quil a (co-)pilotés une expérience forte dans le domaine de lécotoxicologie et dans les approches pluridisciplinaires. En Octobre 2013, il rejoint le Centre Suisse dEcotoxicologie Appliquée (Centre Ecotox Eawag/EPFL) en tant que responsable du groupe Sol et Sédiment. Sintéressant à létude de lécodynamique des contaminants et leurs effets sur lécophysiologie des organismes, ses compétences et ses thématiques de recherche appliquée couvrent aujourdhui :
Le développement dindicateurs écotoxicologiques dexposition et deffets pour évaluer le stresse chimique
Lintégration des indicateurs écotoxicologiques dans des approches de laboratoire et de terrain pour le diagnostic de la qualité des écosystèmes
Le développement de bioessais adaptés pour le biomonitoring actif
Le transfert de compétence vers la sphère opérationnelle (formation).
Régis Lionel VivienExpertise
Systématique classique (oligochètes aquatiques)Ecologie aquatiqueSystématique moléculaireEcotoxicologie des sédiments
Mission
Réalisation de projets de recherche dans les domaines de la systématique, écologie et écotoxicologie:- Application, validation et développement de méthodes biologiques basées sur l'étude des communautés d'oligochètes pour l'évaluation de la qualité des sédiments des cours d'eau et des lacs (sédiment fins/sableux ; sédiments grossiers/milieu hyporhéique)- Développement d'ind
