Elisa OricchioEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Vamsi Krishna Polavarapu, Asli Ece Kasapoglu, Konstantina Georgakopoulou, Eleni Balli A dirigé les thèses EPFL de Maria Christine Donaldson, Elena Battistello, Daniel Pereira Duarte, Frédérica Schyrr, Ruxandra-Andreea Lambuta, Aaron Simone Petruzzella, Jixing Zhong, Justine Epiney Cours Cancer biology I BIO-471 Le cours couvre les mécanismes moléculaires du développement du cancer: le cycle cellulaire; la stabilité du génome; les oncogènes; les g
Paul Joseph DysonPaul Dyson rejoignit l’EPFL en 2002 à la tête du Laboratoire de chimie organométallique et médicinale de l’Institut des sciences et ingénierie chimiques, dont il en assuma ensuite la direction entre 2008 et 2016.
Le prof. Dyson a été récompensé par de nombreux prix dont le Prix Werner de la Société Suisse de Chimie en 2004, le Prix pour les réalisations exceptionnelles en chimie bio organométallique en 2010, la Médaille du Centenaire de la naissance de Luigi Sacconi (2011) de la Société Italienne de Chimie, le Prix de Chimie bio-inorganique de la Royal Society of Chemistry en 2015, le Prix européen pour une chimie durable de la Société Européenne de Chimie en 2018 et le Prix pour la chimie verte de la Royal Society of Chemistry en 2020.
Le prof. Dyson est également mentionné dans la liste établie par Clarivate des chercheurs les plus cités (Clarivate Highly Cited Researcher), avec un H-index >110 (Web of Science et Google Scholar). Paul Dyson a été élu membre de la Royal Société de Chimie en 2010, membre de l’Académie Européenne des Sciences en 2019 et membre à vie de l’Association Américaine pour l’Avancement de la Science en 2020. Au cours des dernières années il s’est vu décerner le titre de Professeurs Hôte par l’Université de Bourgogne, l’Université de Pierre et Marie Curie, l’Université de Vienne, l’Université de Rome Tor Vergara, l'Ecole Nationale Supérieure de chimie de Paris (Chimie ParisTech) et par l’Université de Shangai Jiao Tong.
De 2016 à 2021 il était membre du conseil de la recherche de la division de mathématique, sciences naturelles et de l’ingénieur du Fonds National Suisse. En 2021, il a été nommé doyen de la Faculté des Sciences de Base.
Alexander MathisAlexander studied pure mathematics with a minor in logic and theory of science at the Ludwig Maximilians University in Munich. For his PhD also at LMU, he worked on optimal coding approaches to elucidate the properties of grid cells. As a postdoctoral fellow with Prof. Venkatesh N. Murthy at Harvard University and Prof. Matthias Bethge at Tuebingen AI, he decided to study olfactory behaviors such as odor-guided navigation, social behaviors and the cocktail party problem in mice. During this time, he increasingly got interested sensorimotor behaviors beyond olfaction and started working on proprioception, motor adaption, as well as computer vision tools for measuring animal behavior.
In his group, he is interested in elucidating how the brain gives rise to adaptive behavior. One of the major goals is to synthesize large datasets into computationally useful information. For those purposes, he develops algorithms and systems to analyze animal behavior (e.g. DeepLabCut), neural data, as well as creates experimentally testable computational models.
Ute KochEnseignement et PhD A co-dirigé les thèses EPFL de Delphine Tardivon, Mateusz Waldemar Antoszewski Cours Practical - Radtke Lab BIO-630 Self renewing organs.Flow Cytometry as tools for the analysis of the hematopoietic system.
Demetri PsaltisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Victoria Fay, Colin Nikhil Christian A dirigé les thèses EPFL de Wuzhou Song, Alexandre Goy, Julien Cuennet, Ioannis Papadopoulos, Xin Yang, Grégoire Pierre Jean Laporte, Thomas Jean Victor Marie Lanvin, Seyyed Mohammad Hosseini Hashemi, Nicolino Stasio, Morteza Hasani Shoreh, Marilisa Romito, Pooria Hadikhani, Eirini Kakkava, Joowon Lim, Giulia Panusa, Ahmed Bassam Sayed Ayoub Mohamed Ayoub, Amirhossein Saba, Niyazi Ulas Dinç A co-dirigé les thèses EPFL de Ugur
Christian IseliExpertise
BioinformatiqueComputer engineering
Enseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics
Nicolas Jean Philippe GuexEnseignement et PhD Cours Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Fall) BIO-693(a) Due to its success, this course will take place from 1st to 5th September 2025 in room AAC 0 20.It introduces the workflows and techniques that are used for the analysis of bulk and single-cell RNA-seq data. It empowers students to understand and analyze their own data. Bioinformatic Analysis of RNA-sequencing (Spring) BIO-693(b) Methods: omics in biomedical research BIOENG-519
Giovanna AmbrosiniCurrent Position Senior Scientist, School of Life Sciences, Bioinformatics Competence Center, école Polythechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne.Senior bioinformatician and software engineer with proven experience working in higher education institutions. Solid experience in scientific computing and web design. Proficient in physics and computational genomics, with a focus on high-throughput genomic sequencing data analysis (ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, scRNA-seq, and exome sequencing) and other types of
Georges WagnièresGeorges Wagnières a obtenu son diplôme (MSc) en physique à l'Université de Lausanne, Suisse, en 1986. Il a reçu son doctorat ès science (PhD) en physique (Optique Biomédicale) de l'Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) en 1992, et a effectué un travail de postdoctorat dans les "Wellman Laboratories of Photomedicine" (Harvard Medical School) situés à Boston, MA, USA, en 1993 et 1994. Il a aussi obtenu, en 2001, un "Master in management of technology" délivré par l'Ecole des Hautes Etudes Commerciales (HEC) de l'Université de Lausanne et l'EPFL. Depuis 1994, il gère un groupe de recherche de l'EPFL actif dans les domaines suivants: - Caractérisation et détection de lésions cancéreuses par spectroscopie et imagerie de fluorescence ainsi que par imagerie à fort grossissement. - Traitement du cancer ainsi que d'autres pathologies associées à des désordres immunologiques (maladie de Crohn, Colite ulcéreuse) ou vasculaires par thérapie photodynamique (PDT). - Développement préclinique et clinique de photosensibilisateurs, de marqueurs fluorescents et d'instruments optiques pour le photodiagnostic. - Traitement de diverses pathologies, y compris les maladies neuro-dégénératives (Parkinson, Alzheimer), par photobiomodulation. - Monitorage de la dose optique pour la PDT basée sur l'imagerie de fluorescence de photosensibilisateurs. - Induction de l'extravasation d'agent chimiothérapeutiques par PDT. - Mesure in vivo de la concentration d'oxygène dans des tissus biologiques par spectroscopie et imagerie optiques résolues en temps. - Monitorage d'un traitement au laser de la rétine par imagerie de reflectance. - Développement de distributeurs de lumière pour des applications biomédicales. - Dosimétrie de lumière / Radiométrie. - Spectroscopie et imagerie en optique biomédicale. Georges Wagnières est aussi co-fondateur et a présidé une société "spin-off" de l'EPFL: - Medlight SA, fondée en 1997, qui développe, produit et commercialise des distributeurs de lumière pour la thérapie photodynamique. Georges Wagnières est l'auteur et co-auteur de plus de 235 articles scientifiques dont 150 ont été publiés dans des revues internationales ayant un comité de relecture (review board). De plus, il est inventeur de 18 brevets. Finalement, il supervise ou a supervisé 12 doctorants et enseigne actuellement à l'EPFL l'optique biomédicale et la photomédecine au niveaux "master". Ces cours sont aussi donnés à l'Ecole doctorale (EDCH, EDSV) de l'EPFL. Finalement, il donne le cours intitulé "Physique Générale I" aux biologistes de première année inscrits à l'Ecole de Biologie de l'Université de Lausanne. PUBLICATIONS PRINCIPALES: SVP visiter: https://www.epfl.ch/labs/lifmet/wagnieres/publications/ Vassily HatzimanikatisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Denis Alain Henri Lucien Joly, Luca Milazzo, David Liaskos, Konrad Lagoda, Omar Keshk, Yigit Sibal, Ioannis Tzegiannakis A dirigé les thèses EPFL de Keng Cher Soh, Julien Racle, Noushin Hadadi, Stefano Andreozzi, Stepan Tymoshenko, Meriç Ataman, Joana Raquel Pinto Vieira, Tiziano Dallavilla, Yves Berset, Anush Chiappino-Pepe, Milenko Tokic, Tuure Eelis Hameri, Jasmin Maria Hafner, Homa Mohammadi Peyhani, Daniel Robert Weilandt, Zhaleh Hosseini, Sofia Tsouka, Mar
Li TangEducation and Training Postdoctoral Fellow, Massachusetts Institute of Technology, 2013 - 2016 Ph.D., University of Illinois at Urbana-Champaign, 2007 - 2012 B.S., Peking University, 2003-2007
Priscilla TurelliPositions
2005-présent: Chercheur, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Laboratoire de virologie et génétique, Suisse.
2001-2004: Chercheur dans le laboratoire du Pr D. Trono, Département de Microbiologie, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
1997-2001: Etudiante Post-doctorante dans le laboratoire du Pr D. Trono, Département de Microbiologie, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
Honneurs et prix
2004: Bristol-Myers Squibb AIDS AWARD
1997-1999: Human Frontier Science Program fellowship
Education
June 1997:
PhD in cellular biology.
Final mark:jury congratulations.
Université de la Méditerranée, France.
June 1993:
Post-graduate diploma in cellular biology and microbiology.
INSERM U372, Marseille-Luminy, université de Provence, France.
June 1992:
Master in cellular biology Specialty: genetic.
Final mark: Best master student of this year.
Université de la Méditerranée, France.
June 1987:
Scientific baccalaureate, France.
Enseignement
2009-présent: co-directeur de thèses, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Suisse
2002: Tuteur en virologie pour les étudiants de médecine, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
1996-1997: Tuteur en biologie moléculaire et biochimie, Université de la Méditerranée, Aix Marseille II Sandra Eloise KjeldsenPositions
2008- : Laborantine (Laboratoire du Pr D. Trono), Laboratoire de virologie et génétique, EPFL, Suisse.
2004-2008: Laborantine (Laboratoire du Pr A. Trumpp), ISREC, Suisse.
2004: Assistante de recherche (Laboratoire du Pr G. Corradin), Institut de Biochimie, Université de Lausanne, Suisse.
Éducation
1999 - 2004:
Diplôme en Biologie (spécialités : Immunologie, Biochimie et Pharmacologie)
Université de Lausanne, Suisse.
Juin 1999:
Baccalauréat Scientifique, France. 